تسلسل NA

تسلسل الجينوم الكامل (WGS)

يوفر الاستقصاء الجيني الواسع النطاق نهجًا واسعًا وغير متحيز للتحليل الجيني، ويُستخدم لتحديد التسلسل الكامل للحمض النووي الكامل لجينوم الكائن الحي، بما في ذلك المناطق المشفرة وغير المشفرة. أما التسلسل الجيني غير المشفّر فهو طريقة التسلسل العميق التي تكشف عن كل من الاختلافات الجينية الشائعة والنادرة، وتحدد الطفرات الجينية المرتبطة بالاضطرابات المعقدة والعثور على الطفرات التي تؤدي إلى نمو الورم (مما يساعد على توجيه العلاجات الشخصية)، وتقييم الاستجابات الفردية للأدوية (استنادًا إلى التركيب الجيني)، ويوضح التباين الجيني بين المجموعات السكانية، ويدعم الطب الدقيق. وبالطبع، فإن التسلسل الجيني الوراثي العالمي أكثر تكلفة وكثافة في البيانات من التسلسل المستهدف.

تسلسل تشيب (ChIP-Seq)

في دراسات تنظيم النسخ، يُستخدم ChIP-Seq لتحليل التفاعلات بين البروتين والحمض النووي الريبي (DNA) من خلال الجمع بين الترسيب المناعي للكروماتين (ChIP) مع تسلسل الجيل التالي (NGS). يحدد ChIP-Seq مواقع ارتباط بروتينات محددة محددة على الحمض النووي عبر الجينوم بأكمله. وتوفر هذه الطريقة رسم خرائط عالية الدقة على مستوى الجينوم بأكمله لتفاعلات التفاعلات بين البروتين والحمض النووي. تُستخدم هذه الطريقة في تحليل بنية الكروماتين، وتحديد مواقع ارتباط عامل النسخ ومواقع الارتباط، والمعززات، والمروجات، والمناطق التنظيمية الأخرى المشاركة في تنظيم الجينات، ورسم خرائط تعديل ورسم خرائط التعديل. وتتضمن هذه الطريقة ربط البروتينات بالحمض النووي (للحفاظ على التفاعلات)، وقص الكروماتين والقص، والترسيب المناعي (لسحب مجمعات البروتين-الحمض النووي). أجزاء الحمض النووي المرتبطة بالبروتين لتعيين مواقع ارتباط البروتين.

التسلسل الكامل للإكسوم الكامل (WES)

WES هي تقنية جينومية توفر تسلسلًا عالي العمق لجميع مناطق ترميز البروتين في الجينوم, المعروفة باسم الإكسوم، والتي تشكل حوالي 1-2% من الجينوم بأكمله. تُعد تقنية WES مفيدة بشكل خاص عند التعامل مع الحالات المعروفة بارتباطها بجينات ترميز البروتين. هذه الطريقة فعالة من حيث التكلفة مقارنة بتسلسل الجينوم الكامل الجينوم الكامل (WGS) وتحدد الطفرات التي تسبب الاضطرابات الوراثية والطفرات الجسدية في الخلايا السرطانية, الجينات الجديدة المرتبطة بالأمراض، وحالة حامل المرض للحالات الوراثية.

التسلسل الميتاجيني

التسلسل الميتاجينومي هو دراسة المادة الوراثية المستخلصة مباشرة من الميكروبيوم البشري أو من العينات البيئية. تستخدم هذه الطريقة تقنيات التسلسل العميق والعالي الإنتاجية من الجيل التالي لتسلسل تسلسل ملايين أجزاء الحمض النووي بالتوازي. وعلى عكس الطرق التقليدية، التي تركز على استزراع كائنات حية محددة يقوم الميتاجينوميات بتحليل الحمض النووي لجميع مسببات الأمراض في العينات السريرية، حتى تلك التي يصعب استزراعها أو التي لم يتم تحديدها مسبقاً. أو التي لم يتم تحديدها مسبقًا. لا تتطلب هذه الطريقة معرفة مسبقة بالأنواع الموجودة، مما يجعلها مفيدة في اكتشاف كائنات مجهرية جديدة. يُعد التسلسل الميتاجينومي أداة قوية في كل من الأبحاث الأساسية والسريرية حيث يوفر رؤية واسعة ومفصلة للمجتمعات الميكروبية.

تسلسل الحمض النووي الريبي

RNA-Seq هي تقنية تسلسل عالية الإنتاجية تُستخدم لتوفير رؤية شاملة وغير متحيزة لكامل النسخية بأكملها والتي تشمل جميع جزيئات الحمض النووي الريبي في الخلية. يمكن لخاصية التسلسل العميق الكشف عن النسخ ذات الوفرة المنخفضة منخفضة الوفرة بحساسية عالية. يقيس RNA-Seq التعبير الجيني ويقيس وفرة جزيئات الحمض النووي الريبي لتحديد الجينات النشطة وإلى أي مدى. تبحث هذه الطريقة في كيفية اختلاف التعبير الجيني عبر في ظروف أو أنسجة أو مراحل نمو مختلفة. وعلاوة على ذلك، يكتشف تعداد الحمض النووي الريبي (RNA-seq) كلاً من أنواع الحمض النووي الريبي المعروفة والجديدة, بما في ذلك الحمض النووي الريبي المرسال والحمض النووي الريبي غير المشفر والحمض النووي الريبي الميكروي، ويحدد النسخ الجديدة أو أحداث الربط البديلة، ويبحث في ويبحث في كيفية تغير التعبير الجيني في أمراض مثل السرطان أو الاضطرابات العصبية أو العدوى. باختصار, يوفر RNA-Seq رؤية مفصلة للتعبير الجيني، وأحداث الربط، والأشكال البديلة المتماثلة، وتعديلات الحمض النووي الريبي, ويُستخدم على نطاق واسع في كل من الأبحاث الأساسية والدراسات السريرية لفهم وظيفة الجينات وتنظيمها وجزيئاتها. الجزيئية الكامنة وراء الأمراض.

تسلسل الحمض النووي الريبي غير المشفر

تسلسل الحمض النووي الريبوزي غير المشفر (ncRNA) هو طريقة لتحليل جزيئات الحمض النووي الريبوزي التي لا ترمز للبروتينات ولكنها تلعب أدوارًا حاسمة في تنظيم الجينات والعمليات الخلوية. ويشمل ذلك مجموعة متنوعة من أنواع الحمض النووي الريبوزي، مثل الحمض النووي الريبوزي الميكروي (miRNA)، والحمض النووي الريبي الطويل غير المشفر (lncRNA)، والحمض النووي الريبي النووي الصغير (snoRNA)، والحمض النووي الريبي المتفاعل مع البيوي (piRNA)، وغيرها من ncRNAs (بما في ذلك الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA)، والحمض النووي الريبوزي الريبوزي (rRNA)، وغيرها). يوسع تسلسل الحمض النووي الريبي غير المشفر فهمنا للنسخة، ويوفر العديد من الرؤى حول تنظيم الجينات، وإعادة تشكيل الكروماتين، والمسارات الخلوية الخلوية، وفهم آليات المرض، والكشف عن خلل في تنظيم الحمض النووي الريبي غير المشفر، والكشف عن أدوار الحمض النووي الريبوزي النووي غير المشفر، وغيرها. علاوة على ذلك، تبرز الحمض النووي الريبي غير المشفر كمؤشرات حيوية محتملة للمرض للتشخيص والتشخيص، ولتحديد الأهداف العلاجية الجديدة في الأمراض التي لا تصلح فيها جينات الترميز البروتيني وحدها وحدها لا تفسر علم الأمراض بشكل كامل.